COLOPL'un okul rol yapma oyunundan esinlenilmiştir. Dünya 2045 yılında aniden ortaya çıkan gizemli Irousu yaratıkları tarafından istila edilmiş ve insanlar kendilerini kapana kısılmış halde bulmuşlardır. Bu istilacılara karşı cesurca karşı koyanlar ise her bölgeden güçlü bir ordu veya bir silaha bile sahip olmayan sıradan kızlardır. Shinjugamine kız akademisi de kaderleri Irousularla savaşmak olan "Hoshimori" yıldız gardiyanları için bir okuldur. Oyuncu, kızları eğitmek ve istila edilmiş dünyayı geri almak için bu okula atanır ve çanlar bugün derslerin başladığını bildirmek için okulda yankılanır.