Ryza no Atelier, macera arayışı içinde Kurken Adası'nda yaşayan bir kız olan Stout Reisalin'in hikayesini anlatıyor. Bir yaz günü terk edilmiş bir kayık keşfeder ve arkadaşları Marslink Lent ve Mongarten Tao ile anakaraya doğru yola çıkar. Yol boyunca, Ryza simyacı Vollmer Empel ve arkadaşı Decyrus Lila ile tanışmasıyla simya öğrenme ve iç içe geçmiş maceralara yönelir ve kısa süre sonra evi ile ilgili gerçeği keşfeder.